| Tez Künye | Durumu | ||
| Investigation of ndm enzymes in Escherichia Coli in women and infant children with urinary tract infection in Diyala / Iraq / Diyala / Irak’ta idrar yolu enfeksiyonu olan kadın ve bebek çocuklarda Escherichia Coli’ de NDM enzimlerinin araştırılması Yazar:SAHAR MEZHER ASSI AL-OBAIDI Danışman: DR. ÖĞR. ÜYESİ OKAN ÜRKER Yer Bilgisi: Çankırı Karatekin Üniversitesi / Fen Bilimleri Enstitüsü / Biyoloji Ana Bilim Dalı / Biyoloji Bilim Dalı Konu:Biyoloji = Biology Dizin:Escherichia coli = Escherichia coli | Onaylandı Yüksek Lisans İngilizce 2023 100 s. | ||
| Bu çalışmada, idrar yolu enfeksiyonu olan kadın ve bebek çocuklardan izole edilen çoklu ilaç direnci Escherichia coli’de NDM genlerinin fenotipik ve genotipik olarak saptanmasını amaçladı. VITEK-2 antibiyotik duyarlılığı için kullanılır. bla NDM1, bla NDM2, bla TEM, bla VIM, bla IMP genlerinin moleküler tespiti için PCR kullanıldı. Öte yandan fenotipik saptama, aşağıdakiler gibi bazı virülans faktörlerini belirlemek için kullanıldı, metallo, β-laktamaz ve biyofilm oluşumu. Diala-Irak’taki hastanelerden 200 klinik örnek toplandı, yaşları 2,5 ile 59 arasındaydı. Bakteri MDR testi, moleküler testler için örneklerin bekletilmesinde MacConkey agar, kanlı agar ve EMB agar kültürleri kullanıldı. Sonuç olarak sadece 49 idrar örneğinde E. coli pozitif bulunmuştur, (%27,08) erkek ve (%72,92) kadındır. İzolatlar seftazidim (%100) ve ampisiline (%100) yüksek direnç göstermiş, bunu sefepim (%97,96), sefotaksim (%97,96) ve Amoksisilin-klavulanik asit (%95,91) izlemiş, en düşük seviye ise imipenem (%20.90). İzolatlardaki direnç genleri ise en yüksek sıklıkta (%83,33), bla-SHV (%39,58), bla-VIM (%25), NDM-1 (%37,50) ile bla-TEM geni olurken, hiçbiri bulunmadı. bla-TMP geni için pozitif test edilen izolatların oranı. Tüm E. coli izolatları biyofilm oluşturma kapasitesine sahiptir, toplam izolatların yaklaşık olarak (%91,67) oranındadır. Fonotipik açıdan bakıldığında 49 E. coli izolatından (%31,25) MBL pozitif, buna karşılık (68,75) MBL negatif, 16 MBL pozitif izolattan sadece 5’i Harbor bla-NDM-1 geni, MBL pozitif izolatlardan 15’i sadece 11’i Harbor bla-TEM geni, 16 MBL pozitif izolattan sadece 6’sı Harbor bla-SHV geni, ayrıca 16 MBL pozitif izolattan sadece 6’sı Harbor bla-VIM geni taşıyordu. | |||
| This study was aimed to phenotypic and genotypic detection of NDM genes in multidrug resistance Escherichia coli isolated from women and infant children with urinary tract infection. VITEK-2 uesd for the antibiotics sensitivity. PCR were used for molecular detection of bla NDM1, bla NDM2, bla TEM, bla VIM, bla IMP genes. On the other hand Phenotypic detection were used to identify some virulence factors like, metallo, β-Lactmase and biofilm formation. A 200 clinical samples were collected from hospitals in diala-iraq, the ages were 2.5 to 59 years. MacConkey agar,blood agar and EMB agar cultures were used for holding the samples to the bacteria MDR test, molecular tests. As a results Only 49 urine samples were positive for E. coli, (27.08%) infants and (72.92%) females. The isolates showed high levels of resistance to ceftazidime (100%) and ampicillin (100 %), followed by cefepime (97.96%), cefotaxime (97.96%), and Amoxicillin-clavulanic acid (95.91%), while the lowest level was for imipenem (20.90%). Meanwhile the resistance genes in isolates was bla-TEM gene with highest frequency at (83.33%), bla-SHV (39.58%), bla-VIM (25%), NDM-1 (37.50%), On the other hand, none of the isolates tested positive for the bla-TMP gene. All of the E. coli isolates have the capacity to build biofilm, around (91.67%) of the total isolates. For phonotypically perspective out of 49 E. coli isolates (31.25%) were positive for MBL, in contrast (68.75) were negative for MBL, out of 16 MBL positive isolates only 5 isolates were harbor bla-NDM-1 gene, out of 15 of MBL positive isolates only 11 isolates were harbor bla-TEM gene, while out of 16 MBL positive isolates only 6 isolates were harbor bla-SHV gene, out of 16 MBL positive isolates only 6 isolates were harbor bla-VIM gene. | |||